種種迹象顯示，高官問責制既不是董建華的構思，也不是中央政策組或有關官員研究並提交的方案，而很可能是北京的意見，中央的指示。
事情的起源是兩年前的港大民調風波。當時中國領導人及香港親中人士，已確定鍾庭耀事件是香港某些人的「倒董」陰謀，而「倒董」的目的則是要擺脫中央對董施政的支持，實際上是要搞脫離「一國」的「自主」。當時，中方喉舌《文匯報》，連續每天以整版篇幅，在大標題「堅決支持特區政府依法施政」之下，以政協香港區委員座談、親中社團座談以及訪問親中人士等專稿，表示要反擊「倒董」「逆流」，大有文革期間製造輿論「反擊右傾風」的味道。
掀起「倒董」「逆流」的是哪些人呢？曾表示自己代表「中央的意見」的鄔維庸醫生在港台「香港家書」中明白表示，反董的幕後黑手，是「思想受到前朝遺毒影響的政府掌權人士，繼續為（英國人）光榮撤退塗脂抹粉」，「延續着前朝戰略思維，積極與內地疏離隔絕，刻意製造和凸顯香港和內地的差異。」
「政府掌權人士」，非常明顯，指向的是公務員之首的政務司司長陳方安生。按照中國共產黨傳統的敵情觀念，敵人（前朝）培養的人都是歷史背景有問題之人，絕不可靠。出現了鍾庭耀事件，更證明他們在「延續着前朝的戰略思維」也。因此，決不能由港英時代的公務員之首繼續擔任政府首長。
前年九月底，中央急召陳方安生到北京，由錢其琛向陳太傳達中央的意向：希望全體公務員支持行政長官董建華管治香港。而港澳辦主任廖暉及其下屬更當面訓斥陳太，要她「好好配合特首施政」。
前年十二月，江澤民到澳門出席回歸一周年慶典，在大會上，他「藉澳批港」地表示：「希望各界人士都自覺維護行政長官的權威，支持、幫助行政長官施政」。更重要的，是他表示：「行政長官既是特別行政區的首長，也是特區政府的首長。」
這兩個「首長」有啥不同？前者意味着可以是虛位的元首，後者則是主控政府各部門的執政首長。也就是說，他認為公務員之首不應是政務司司長，而應是行政長官。
高官問責制的格局，就這樣由江澤民一言九鼎地定下來了。具體細節是不是由中央設計？最近有這一類的傳聞。筆者相信，至少行政會議主要由各問責高官組成，以及設立大內總管即行政長官辦公室主任，這兩項組織架構，與中國專權政治的構思十分接近，很可能是北京的主意。